Комисија за заштиту конкуренције је Законом дефинисана као самостална и независна организација која врши јавна овлашћења и која за свој рад одговара Народној скупштини којој подноси годишњи извештај о раду.

Независност Комисије од извршне власти обезбеђује се начином избора органа Комисије, односно председника Комисије и чланова Савета Комисијe, али и кроз финансијску независност, с обзиром на то да се Комисија финансира из сопствених прихода и доноси годишњи финансијски план на који Влада Републике Србије даје сагласност.